置顶 第一次在广州番禺区做CNV-seq 核型异常检测(通用版)指南

CNV-seq 染色体异常测定作为一项基因检测服务，在广州番禺区已有正规机构可以开展。

检测范围说明

本检测采用高通量测序平台，将基因组DNA超声打断并制备文库，实施低深度（1×）全基因组测序，数据比对至GRCh37/hg19参考基因组，并经UCSC、DGV、OMIM、DECIPHER、PubMed、ISCA等国际数据库注释。覆盖范围包括全基因组层面100kb以上的拷贝数变异（CNV），可检出染色体非整倍体（如21、18、13三体及性染色体异常）以及微缺失/微重复综合征（如DiGeorge、Williams、Prader-Willi等）。对于流产组织，可明确15号染色体三体等常见流产病因（占早期自然流产1.68%）。检测不能识别多倍体、单亲二倍体、平衡易位、倒位、环状染色体、嵌合体、100kb以下缺失/重复，以及高度重复或GC含量高区域的变异。检验报告周期7-10个工作日，价格2100元。

谁需要做这个检测

• 复发性流产或胚胎停育的夫妇，需明确流产组织染色体病因指导再生育决策。
• 产前超声异常或NIPT高风险的孕妇，需羊水穿刺确诊胎儿染色体非整倍体及微缺失。
• 不明原因智力发育迟缓、多发畸形的儿童，需筛查全基因组微缺失/微重复综合征。
• 自闭症谱系障碍患儿，约10-15%存在可检测CNV异常，需明确单基因病因。
• 高龄孕妇（≥35岁）产前诊断，需全方位评估胎儿染色体结构及数目异常风险。
• 死胎或胎儿宫内发育异常案例，需绒毛或羊水样本分析染色体病因。

检测可信度

检测基于高通量测序平台，对100kb以上CNV检出率高，变异分类参考国际标准（ACMG/ClinGen共识），结果包括致病、可能致病、临床意义未明等。存在结果提示明确的染色体病因，如15三体导致流产；排除结果不排除其他原因（如单基因病、母体因素）。临床意义未明变异需父母验证及结合表型综合判断。建议阳性结果通过核型或CMA复核，以确保临床决策的可信度。

采样简易，无需空腹。样本类型包括外周血（EDTA抗凝血≥2mL）、羊水、绒毛或流产物组织。在广州本地域可通过合作医务所或采集点完成采取，提供冷链邮寄（4℃运输，24小时内送达）。DNA样本需≥1μg，流产物绒毛样本在清宫术或自然排出后立即采集最佳，避免母体污染。无需细胞培养，直接提取DNA，缩短等待周期。

操作流程一览

1. 临床咨询：医生评估适用场景，开具CNV-seq检测申请。
2. 样本采集：在广州医院或中心抽取外周血或采集羊水/绒毛/流产物组织。
3. 样本运输：4℃冷链邮寄至实验室，24小时内送达。
4. 基因组DNA提取：从样本中提取基因组DNA，质检合格后进入文库构建。
5. 文库构建：超声打断DNA，制备测序文库。
6. 上机测序：使用高通量测序平台进行1×低深度全基因组测序。
7. 数据分析：生物信息流程比对至hg19，经多数据库注释变异，分类致病性。
8. 报告出具：7-10个工作日内生成报告，由遗传咨询师解读，发送至医生或病人。

必要提醒

• 检测仅针对≥100kb的CNV，不覆盖平衡易位、倒位、多倍体等结构异常。
• 结果解读可能随科学进展变化，临床意义未明变异需结合父母检测及表型。
• 样本需避免母体血液污染（格外流产物绒毛），否则影响准确性。
• 检测不适用于体细胞突变、新生点突变及嵌合体检测。
• GC含量高或重复序列区域可能存在假阳性，数据已排除这些区域。
• 报告周期为7-10个工作日，从到样日算起，不含节假日。
• 阳性结果建议通过核型或CMA复核，以确认临床诊断。
• 检测费用2100元，不包含遗传咨询附加费用。